2006年，我校原软件与食品工程系食品加工技术专业即开始招生。2016年7月食品工程系成立,现设有食品智能加工技术、食品检验检测技术、食品营养与健康3个专业。食品加工技术专业2011年被评为省级特色专业，获得了中央财政支持高等职业学校提升服务产业发展能力的建设项目。2023年在中国科教研究院发布的金平果高职专业同类专业竞争力排行榜中，我校拟定首批升本专业食品营养与健康专业排名全国第一，前三年该专业全国排名分别为第三（2020年）、第二（2021年）、第二（2022年），安徽省排名均为第一。食品营养与健康专业群立项为2023年安徽省“双高计划”中高水平专业群。我校成为“乍得国家职业标准共建互认项目”食品药品与粮食大类农产品食品检验员（5级）牵头开发单位。2023年4月，我校被中国食品工业协会聘为中国食品产教融合共同体常务理事单位。

食品工程学院师资力量雄厚，现有专任教师24人，其中教授6人、博士2人，多名教师获得食品检验工（高级技师）、公共营养师（技师）等职业资格证书，获评/聘全国食品工业职业教育教学指导委员会委员1人、世界技能大赛全国选拔赛裁判员1人、省级专业带头人1人、省级教学名师1人，全国信息化教学大赛获奖1项，省级教师教学能力大赛获一等奖1项，二等奖2项。近几年，教师主持省级教科研项目20项，一类期刊发表论文8篇，建成省级食品专业群高水平教学团队。近年来，学生获国赛优胜奖1项，二等奖2项，省赛一等奖2项。2023年分别获得全国职业院校技能大赛（高职组）食品安全与质量检测赛项和生物技术赛项三等奖。

食品工程学院实习实训设施配备齐全，目前共建有23间功能馆室，使用面积2000余平方米。此外与31家食品、药品单位签订合作协议，与蒙牛乳业（马鞍山）有限公司、马鞍山达利食品有限公司等5家企业签约实习基地。与黄池食品有限公司共建现代学徒制人才培养项目，与安徽皓元药业有限公司签订了订单班协议。与行业企业深入开展产学研合作，获批国家发明专利3项。

食品工程学院毕业生就业渠道宽、范围广，2023年整体就业率为95.82%、在马就业率为35.78%、专升本报名录取率为72.28%(2024年录取率达85.08%）。   

（以上数据截至2024年5月）